Las Comisiones Asesoras son órganos que asesoran al Directorio en lo concerniente a distintos asuntos de evaluación.
Las comisiones disciplinares y por gran áreas son las que se conforman en torno a una o más disciplinas científicas o grandes áreas del conocimiento.
Las comisiones Asesoras de temas estratégicos evalúan ingresos y promociones de postulantes cuyo tema de investigación se enmarca en los Temas Estratégicos. Estas comisiones se constituyen en función del núcleo socio-productivo de cada TE.
Las comisiones asesoras multidisciplinares y ad hoc son las que no están organizadas en torno a una disciplina o tema estratégico.