Las Comisiones Asesoras son órganos que asesoran al Directorio en lo concerniente a distintos asuntos de evaluación.

Las comisiones disciplinares y por gran áreas son las que se conforman en torno a una o más disciplinas científicas o grandes áreas del conocimiento.

Las comisiones Asesoras de temas estratégicos evalúan ingresos, becas y promociones de postulantes cuyo tema de investigación se enmarca en los Temas Estratégicos. Estas comisiones se constituyen en función del núcleo socio-productivo de cada TE.

Las comisiones asesoras multidisciplinares y ad hoc son las que que evalúan los siguientes asuntos:  ingresos a investigador correspondiente,  ingresos para Y-TEC,  Proyectos de preservación y de recuperación de colecciones de interés científico de argentina - proyecto de fortalecimiento de colecciones arqueología, Proyectos de preservación y de recuperación de colecciones de interés científico de argentina - proyecto de fortalecimiento de colecciones biológicas,  PIO Conicet- UNAHUR, PIO Conicet- BCRA, PIO Conicet- UNLP-UNAJ,  Becas Conicet-ANLAP,  Conicet-Fundación YPF para becas y proyectos, PIP Raíces, Premio Conicet -Merck, Premio Loreal, Premio Milstein,  Becas CONICET/INTA, Convocatorias especiales e internacionales,   Ingresos por proyectos especiales,  Proyectos museos. Conicet - ministerio de cultura y Recursos para ingresos por temas estratégicos y fortalecimientos I+D+I