Las Comisiones Asesoras son organos que asesoran al Directorio en lo concerniente a distintos asuntos de evaluación. 

Estas comisiones  Asesoras  disciplinareas y por gran área  están integradas por especialistas de reconocida trayectoria, equivalente o superior a la Clase Investigador Independiente del CONICET, y tienen por misión asesorar al Directorio del CONICET en lo concerniente a las presentaciones de ingresos, informes, promociones, proyectos PIP y becas. Para el desempeño en sus tareas, las Comisiones deben seleccionar los Pares Consultores en los trámites que así lo requieran. 

Las comisiones Asesoras de temas estratégicos evalúan ingresos, becas y promociones de postulantes cuyo tema de investigación se enmarca en los Temas Estratégicos. Estas comisiones se constituyen en función del nucleo socio-productivo de cada Temas Estratégicos

(*) Refieren a las Comisiones que evalúan convocatorias especiales e internacionales, Becas CONICET/INTA, CONICET/AACREA, Ingresos por proyectos especiales,  EL PROYECTO DE INVESTIGACIÓN ORIENTADA CONICET-UNLP-UNAJ, a el Comité de Etica y a las Comisiones consultivas por Gran Area